Dal 1990 Markus Schlee gestisce uno studio privato specializzato in parodontologia e implantologia a Forchheim, in Germania. Ha conseguito le qualifiche di specialista in parodontologia (DGP) e implantologia (BDIZ e DGI). È membro di numerose associazioni professionali, tra cui Neue Gruppe, DGP, DGI, AAP, IADR, ECDI, DGÄZ e APW. Nel 2015 ha ottenuto la cattedra esterna all'Università Goethe di Francoforte, dove è tuttora affiliato. È docente nei programmi di master dell'Università Goethe di Francoforte (MOI), del DGI dell'Università Steinbeis di Berlino, del DGP dell'Università Internazionale di Dresda e del DGÄZ dell'Università di Greifswald. Ha tenuto numerose conferenze ed è autore di molte pubblicazioni, sia a livello nazionale che internazionale, nei campi di parodontologia, implantologia, rinforzo dell'osso perimplantare, gestione dei tessuti molli, microchirurgia, piezochirurgia ed estetica